特定口座源泉徴収ありの確定申告は20万円以下でもできる？還付条件と手続き方法をわかりやすく徹底ガイド

「特定口座（源泉徴収あり）なら確定申告は不要」――よく聞くフレーズですが、20万円以下の利益がある年に限っては、あえて申告することで税金が戻ってくるケースがあるのをご存じですか？この記事では、源泉徴収ありの特定口座ユーザーが還付を受けられる条件や手続き、損益通算のチャンスを具体的な数字とともに解説します。

源泉徴収税率（特定口座）: 20.315%（所得税15.315%＋住民税5%） ·
確定申告不要の条件（給与所得者）: 給与所得以外の所得が年間20万円以下 ·
特定口座（源泉徴収あり）利用者: 原則として確定申告不要、ただし還付を受けるには申告が必要 ·
還付金の到着目安: 確定申告後約1～2ヶ月

この記事のポイント

1確認済みの事実

源泉徴収あり口座では売却時に税金が差し引かれるため、通常は確定申告不要（Meets More（税理士紹介サービス））
給与所得者で給与以外の所得が20万円以下の場合、確定申告が不要（Koyano CPA（税理士事務所））
還付を受けるためには確定申告が必要（MUFG証券FAQ）

2不明な点

すべてのケースで還付が発生するわけではない（年収や他の所得による）
損失の繰越控除は確定申告が前提だが、源泉徴収あり口座でも適用可能かどうかの判断は個別の状況による

3タイムラインのポイント

毎年1月1日～12月31日：株式取引の年間損益を計算する対象期間
2月16日～3月15日：確定申告の受付期間（所得税）
申告後1～2ヶ月：還付金が指定口座に振り込まれる

4今後の流れ

確定申告をすれば、源泉徴収された税金の一部が還付される可能性がある
e-Taxを利用すれば手続きが簡略化され、還付も早くなる場合がある

4つのファクト、1つのパターン：源泉徴収ありの口座では自動課税されるが、その税額が本来の税額より多い場合にのみ還付が発生する。単純な「申告不要ルール」の裏には、条件次第で申告が有利に働くロジックが潜んでいる。

項目	値
特定口座の源泉徴収税率	20.315%
給与所得者の確定申告不要ライン	給与以外の所得20万円以下
還付金の標準到着期間	申告後1～2ヶ月
e-Taxでの申告可能期間	2月16日～3月15日（延長あり）

特定口座源泉徴収ありで確定申告は不要ですか？

給与所得者の確定申告不要制度とは

源泉徴収あり口座では税金が自動的に徴収されるため、通常は確定申告不要（Meets More）
ただし、20万円以下の利益でも還付を受けるために申告する選択肢がある

なぜ重要か

給与所得者にとって20万円ルールは安全策だが、源泉徴収あり口座で自動課税された税金を取り戻すには、あえて申告の手間をかける必要がある。このトレードオフを理解していないと、本来もらえる還付を逃すことになる。

20万円ルールと特定口座の関係

給与所得が2,000万円以下の会社員で年間譲渡益が20万円以下の場合、源泉徴収なし特定口座を選ぶことで税負担を回避できる（Koyano CPA）
年金収入が400万円以下の年金受給者は、同じく年間譲渡益20万円以下であれば確定申告が不要（同上）

確認点

源泉徴収あり口座では自動的に税金が差し引かれるため、20万円以下でも課税される。一方で、源泉徴収なし口座なら20万円以下の利益は非課税。この非対称性が、還付申告の動機になる。

つまり、源泉徴収あり口座の利用者は、20万円以下の利益でも「課税済み」の状態にある。申告不要制度は「手続き不要」を意味するだけで、税額が戻らないわけではない。

特定口座源泉徴収あり確定申告どうなる？

源泉徴収ありの仕組み

源泉徴収あり口座では売却時に税金が差し引かれる（カブドットコム証券投資ガイド）
特定口座内で自動的に損益通算が行われる（同上）

申告した場合としなかった場合の違い

申告することで他口座の損失と損益通算が可能（松井証券サポート）
申告しなければ還付は受けられない

注意点

申告しない場合、源泉徴収された税額はそのまま国庫に収まる。他口座で損失が出ていても通算できず、結果的に納め過ぎになるリスクがある。

「特定口座（源泉徴収あり）をご利用の場合、特定口座内で売買した上場株式等の譲渡所得は自動的に損益通算されます。」（みずほ証券FAQ）

キャッチ：源泉徴収あり口座は便利だが、他の口座との損益通算や配当金の総合課税変更といった節税策を活かすには、確定申告が不可欠。自動処理の裏で見逃しがちなポイントだ。

株で20万円以下で確定申告したらどうなる？

申告した場合の還付の可能性

利益が20万円以下でも確定申告が可能
源泉徴収あり口座で納めすぎた税金があれば還付される（MUFG証券FAQ）

損益通算のメリット

損失がある場合は損益通算で将来の税金を減らせる（松井証券サポート）

具体例：専業主婦が特定公社債の利子20万円を受け取り（20.315%の源泉徴収）、他の所得がない場合、確定申告により源泉徴収税額が還付される（みずほ証券FAQ）。同様に、給与所得者が20万円以下の株利益で源泉徴収された税金も、年間の所得税率が低ければ還付対象になる。

「源泉徴収された税額が年間の所得金額により算出した所得税額より大きい場合、還付申告により納め過ぎた所得税の還付を受けることができます。」（MUFG証券FAQ）

還付が発生するかどうかは、課税総所得と源泉徴収額の比較で決まる。単純に「20万円以下だから還付」とは限らず、個別の所得状況が鍵を握る。

特定口座「源泉徴収あり」でも、確定申告をしたほうが有利になるのは

源泉徴収あり口座でも申告するメリット

他口座の損失と通算できる（松井証券サポート）
配当金を総合課税に変更することで税率が下がる場合がある
医療費控除など他の控除と組み合わせるとさらに有利

3つのメリット、1つの共通点：確定申告をすることで初めて使える制度ばかり。源泉徴収あり口座の簡便さとトレードオフになる。

比較項目	確定申告あり	確定申告なし
他口座の損失との通算	可能	不可
配当金の総合課税選択	可能	不可（源泉分離のまま）
医療費控除との併用	可能	不可
還付の可能性	あり	なし

メリット

損益通算で納税額を減らせる
配当金の税率を下げられる可能性
他の所得控除と組み合わせられる

デメリット

申告の手間と時間
記入ミスによる税務調査リスク
20万円以下の利益で申告しても還付が発生しないケースもある

「特定口座（源泉徴収あり）で年間損益合計がプラスとなる場合、一般口座や他の証券会社の年間損失と通算することで還付を受けることができます。」（松井証券サポート）

申告が有利なのは、複数口座の損益を合算したい投資家、または配当金の課税方式を変更したい人だ。ただし、手間とミスのリスクを考慮すると、誰にでもおすすめできるわけではない。

特定口座源泉徴収ありの場合、還付はいつ受けられますか？

確定申告の提出期限

確定申告は原則2月16日～3月15日（所得税）

還付金の入金タイミング

還付金は申告後1～2ヶ月で指定口座に振り込まれる
e-Taxを利用すると処理が早まる場合がある

還付手続きのステップ

年間取引報告書を証券会社から取得する
国税庁の確定申告書等作成コーナーでe-Taxまたは書面で申告する
源泉徴収票や年間取引報告書の数値を入力する
還付額が表示されたら確認し、送信または郵送する
指定した銀行口座に還付金が振り込まれる

スピードの鍵

e-Taxで申告すれば、書面より数週間早く還付が受けられることも。確定申告期間中は処理が集中するため、早めの申告が吉。

「源泉徴収あり特定口座の利用者は、原則として確定申告不要ですが、還付申告は可能です。」（SBI証券FAQ）

還付を受けたいなら、期限内に確実に申告する。遅れると還付が翌年以降になる可能性もある。

確認済みの事実

源泉徴収あり口座では売却時に税金が差し引かれるため、通常は確定申告不要
給与所得者で給与以外の所得が20万円以下の場合、確定申告が不要
還付を受けるためには確定申告が必要

不明な点

すべてのケースで還付が発生するわけではない（年収や他の所得による）
損失の繰越控除は確定申告が前提だが、源泉徴収あり口座でも適用可能かどうかの判断は個別の状況による

結論：源泉徴収あり口座のユーザーにとって、確定申告は「義務」ではなく「選択肢」だ。20万円以下の利益なら申告不要だが、還付や損益通算のメリットを得たいなら積極的に申告すべき。申告を選ぶ投資家にとって、e-Taxを活用した簡便な手続きと早期の還付が現実的な選択肢となる。

よくある質問

特定口座で源泉徴収ありを選んでも確定申告はできますか？

はい、可能です。源泉徴収あり口座でも、還付を受けたい場合や他の口座の損失を通算したい場合に確定申告ができます。

20万円以下の利益で確定申告すると、必ず税金が戻ってきますか？

必ず戻るわけではありません。源泉徴収額が本来の税額より多い場合にのみ還付が発生します。

副業収入と株の利益を合計して20万円を超えた場合、どうすればよいですか？

給与所得以外の所得合計が20万円を超える場合は確定申告が必要です。株の損失があれば損益通算することで納税額を減らせる可能性があります。

特定口座の源泉徴収ありから源泉徴収なしに変更できますか？

はい、証券会社に所定の手続きを行えば変更可能です。ただし、変更後の取引から新しい設定が適用されます。

損失が出た年に確定申告をしないと、繰越控除は使えませんか？

損失の繰越控除を適用するには、損失が発生した年に確定申告（損失申告）が必要です。申告しなければ翌年以降に繰り越せません。

還付金が振り込まれるまでにどのくらい時間がかかりますか？

申告後、通常1～2ヶ月程度で指定口座に振り込まれます。e-Tax利用で早まる場合があります。

Additional sources

faq.sbisec.co.jp, biz.moneyforward.com